汤景卖掉祖传的家业，在鼓楼附近买了座刚刚落成的三进三出大宅子，罗氏姐妹被安置在内宅的西北角院，内有朱辉和汤景的两个侄女看管，外有应天府衙门的官差保护。
在许灵儿的安排下，涛前来探望罗氏姐妹，他的侄女阿莹已经半岁了，在何氏夫人的照料下，她们在生活上衣食无忧，只是罗阿敏还在惦记着林风。
当罗阿敏从涛的口中听说，林风在锦江湾遇难的消息，顿时就昏厥了过去，阿萍掐住她的人中，含着泪把姐姐唤醒，在涛和阿萍的安慰下，罗阿敏终于接受了这个现实。
涛在南京只住了一日，便独自去了琉球，他要安排马五的商团接管林风的那些据点，让这些海盗出身的掌柜们改邪归正；许灵儿完成这次任务之后，又搭乘商船返回了萨摩，准备执行下一步的行动，经过半个多月的航行，许灵儿在津坊町见到了郭国强。
郭国强告诉许灵儿，依然没有找到朱均旺和徐鲲的下落，他曾到小谷城想把她的父亲接回来，但没有成功，阿市夫人已经有了三个女儿，但浅井长政想要个儿子，离不开这位家庭医生，因此，派权三郎等人把他看护得非常紧。
许灵儿十分担忧其父的安全，想再次赴小谷城去求阿市夫人，郭国强不放心，给她出了一个主意，让她到京都去找幕府老臣上野清延、大馆晴忠和细川藤孝等人，或许他们可以说服浅井长政，把许仪后放出来；同时，请这些幕府老臣帮忙，尽快将陆云龙的灵柩从京都运出来，让陆大人魂归故里。
对这几位幕府老臣，灵儿并不陌生，当年，帮助将军夫人逃难的时候，和他们都打过交道，因此，灵儿相信他们肯定能帮忙，便决定直接前往京都去找他们。
许灵儿满怀信心地到了京都，前去拜访细川藤孝的时候才知道，这几位老臣因对足利义荣不满，全都到越前投奔足利义昭去了。
于是，灵儿不顾生命危险，又从京都前往越前，一路上战火纷飞、焦土遍野，这时，她多么希望涛能够出现……
到了越前一打听，却大失所望，原来，这些幕府重臣到来之后，拥立足利义昭为幕府将军，催促朝仓义景和松永久秀开战，而朝仓义景以实力不足为由，拒绝了足利义昭等人的要求。
朝仓义景的家臣明智光秀暗中与猴子秀吉有所勾结，在他俩的策划下，足利义昭带领这些幕府老臣和明智光秀等人，离开了越前，到岐阜投奔织田信长去了。
当许灵儿马不停蹄抵达岐阜城外的时候，已是永禄十一年的九月，这时，织田信长正在整顿兵马，准备亲率六万大军上洛。
因无法靠近岐阜城，许灵儿判断，用不了太久，织田信长便会带着足利义昭等人上洛，便又返回了京都。
到了月底，织田大军开赴京都，把持京畿一带大权的三好义继和松永久秀等人，深知织田信长的厉害，不敢抵抗，他们偷偷地害死了傀儡将军足利义荣，全体出城投降。
自此，执掌京畿大权的三好家族全面垮台，在织田信长的支持下，足利义昭登上了室町幕府第十五代将军的宝座。
占据京都之后，织田信长并没有给将军足利义昭任何自由，而是把他和那些幕府老臣们全部软禁了起来，因此，许灵儿依然没有机会。
足利义昭看出了织田信长的狼子野心，提议他出任副将军一职，却被织田信长拒绝了。
织田信长派明智光秀和羽柴秀吉两人共同担任京都奉行，他自己的官位由从六品的上总介，晋升为正四位的弹正大弼，并上奏天皇，给幕府将军制订了“殿中御掟”九条律法，后来又追加了七条，让足利义昭昭告天下。
同时，织田信长又命“天下”所有的大名“上洛”，以示臣服，等了很久，也没人买他的账，于是，织田信长决定“杀鸡儆猴”，首先对朝仓义景发难。
战火马上快要烧到小谷城了，得知这个消息后，许灵儿心急如焚，实在不能再等了，迫不得已，才决定前往石山本愿寺，去找显如帮忙。
在石山本愿寺，显如依然热情地接待了许灵儿，并立刻派僧兵前往小谷城去接许仪后。
此时，浅井长政正在越前协助朝仓义景，抵御织田氏大军的进攻，权三郎以没有家督的命令为由，坚决不肯放人，任凭阿市夫人求情也没用。
许灵儿只好在石山本愿寺住了下来，一直等到过了年，形势出现了一些变化。
因“殿中御掟”十六条律法惹怒了足利义昭，这位幕府将军终于忍无可忍，号召天下大名联合起来，打倒织田信长。
于是，朝仓义景、浅井长政、武田信玄、毛利辉元、三好三人众、比睿山延历寺、杂贺众等势力，再加上石山本愿寺，全都积极响应，组成了一张信长包围网。
为了对抗这张围网，织田信长把朝仓义景和浅井长政当作主要敌人，这场战争持续了近一年的时间。
在此期间，显如还曾多次派人去找浅井长政，希望他能把许仪后送到石山本愿寺，因浅井长政请许仪后担当了他三个女儿的私塾先生，婉言拒绝了显如的请求，并表示，他会在小谷城尽心保护许仪后，但如果非要把许仪后送出来的话，无人能保证途中的安全。
打听不到朱均旺和徐鲲的下落，又接不回自己的父亲，织田信长霸占着京都，没有那几位幕府老臣的帮忙，也无法运出陆云龙的灵柩，因此，许灵儿只好继续住在石山本愿寺等待机会。
元龟元年（公元150年，大明隆庆四年），织田信长联合德川家康，打败了浅井长政和朝仓义景的联军，史称姊川之战，与此同时，又开始出兵讨伐摄津国。
摄津国的三好三人众派人找堺町的商人求助军费，因堺町众合会被小西隆佐所把持，没人给他们一钱，这三位只好来找显如求助，显如为了对抗堺町众合会，维护地内町的商业利益，对他们伸出了援手。
浅井长政、朝仓义景和比叡山延历寺组成三万联军，从琵琶湖西岸向织田信长的领地发起猛烈攻击，织田家的名将森可成和信长之弟信治战死。
正在摄津国征战的织田信长得知消息后，立刻带领本部人马往回撤，浅井和朝仓联军在比睿山布阵，准备迎战织田大军。
得知显如暗中支持三好三人众，织田信长从摄津国撤军的同时，却对石山本愿寺大军压境，蛮横的向显如索要巨额军费。
显如拒绝了织田信长的无理要求，开始发动一向宗信众，在伊势长岛掀起一向一揆，就这样，织田信长陷入了多面作战的困境。
无休止的战争还在继续，突然有一天，朝仓义景接到了一封信，织田信长在信中写道：他即将奏请正亲町天皇，天下尽归朝仓家所有……
天真的朝仓义景不明觉厉，立刻表示愿意和解，给了织田信长一个喘息之机。
由于织田信长连年征战，军费极为紧张，特别是对遍地的一向宗信徒和延历寺、本愿寺的僧兵，几乎没有一点办法。
为了让一向宗退出京畿一带，织田信长对外叫嚷着要火烧石山本愿寺，令显如十分担心，便劝许灵儿到堺町去避难。。
许灵儿离开石山本愿寺之后，并没有到堺町避难，而是再次前往京都，希望能联络到那几位幕府老臣。
就在灵儿走后不久，猴子秀吉来到了石山本愿寺，他就像织田信长肚子里的蛔虫，十分清楚织田信长的用意。
显如对秀吉的印象还算不错，但这次秀吉作为织田信长的使者而来，便不咸不淡地接待了他。
拜见显如之后，秀吉先唱了一番赞歌，接着讲道：“此番前来，是和权僧正法王大人商议件大事，织田弹正大弼大人虽自称信仰法华宗，但其性格暴烈，请不要激怒与他，他可是什么事都能做得出来的。”
“难道还能与佛祖为敌否？”
“这正是我所担忧的，火烧本愿寺不是没有可能！”秀吉严肃地答道。
“阿弥陀佛，若说别人敢做佛敌，我不信，说信长公能干出这样的事情，我信，请问奉行大人有何良策？”